A Igreja de São Francisco Xavier está localizada em São Francisco Xavier, no Funchal, na Ilha da Madeira, em Portugal. É uma igreja barroca do século XVIII, que foi construída com um estilo misto de influência portuguesa e espanhola. A igreja foi construída entre 1675 e 1681 e posteriormente reconstruída no século XVIII, após um incêndio ter destruído parte da estrutura original. A sua fachada é composta por duas torres em estilo neoclássico e um frontão decorado com estátuas de São Francisco Xavier e São Pedro. O interior da igreja contém altares decorados em estilo rococó, com várias imagens sagradas e pinturas em tela, bem como afrescos nas paredes e no teto. Uma capela lateral contém a imagem de Nossa Senhora do Livramento, padroeira da aldeia. A Igreja de São Francisco Xavier é também conhecida por ser um local de peregrinação durante as celebrações da Festa de São Francisco Xavier, que ocorre a 3 de Dezembro.