A Igreja de São João é um templo cristão localizado na freguesia de São João de Negrilhos, no concelho de Beja, em Portugal. Foi construída no século XVI em estilo gótico-manuelino e fazia parte de um antigo convento dominicano. Durante o século XIX, a igreja passou por algumas remodelações, com destaque para os trabalhos de pintura no seu interior e a construção de uma torre sineira. Atualmente, é considerada um exemplo notável da arquitetura religiosa da região e ainda conserva algumas obras de arte sacra interessantes, como um retábulo seiscentista. A igreja é um importante centro de culto para os habitantes da freguesia, acolhendo diversas celebrações religiosas ao longo do ano, como a festa do padroeiro, São João Batista. Além disso, está aberta à visitação pública, sendo um destino turístico bastante procurado por quem visita a região.