A Igreja de São Sebastião está localizada na freguesia da Calheta de Nesquim, na ilha Terceira, Arquipélago dos Açores. É uma igreja pequena e simples, construída no século XVI, com alterações subsequentes nos séculos XVII e XVIII. A igreja é dedicada a São Sebastião, o mártir cristão do século III que é muito venerado pelos açorianos como protetor contra doenças, pragas e epidemias. A igreja tem uma planta retangular, com uma única nave e uma capela-mor mais baixa e estreita. O interior é simples, com um altar-mor em pedra decorada com colunas salomónicas e com um retábulo de madeira dourada com a imagem do padroeiro. No teto da capela-mor encontra-se um óculo com uma pintura que representa o martírio de São Sebastião. A Igreja de São Sebastião é um dos principais locais de culto e devoção da Calheta de Nesquim, atraindo fiéis de toda a ilha durante as festas em honra do padroeiro, celebradas em janeiro.