A Igreja de São João Baptista é uma igreja católica localizada na Fajã da Ovelha, no município do Funchal, na ilha da Madeira, em Portugal. Foi construída no século XVI e é uma das mais antigas igrejas da ilha. A igreja é dedicada a São João Batista, considerado o padroeiro da freguesia. É um edifício de estilo barroco, com uma fachada simples e uma torre sineira. O interior da igreja apresenta três altares, o altar-mor dedicado a São João Baptista e os dois altares laterais dedicados à Mãe de Deus e a São Vicente Ferrer. A igreja também possui algumas peças de arte sacra notáveis, incluindo um crucifixo do século XVI e uma imagem de Nossa Senhora da Conceição do século XVIII. A igreja ainda desempenha um papel importante na comunidade local, acolhendo diversas atividades e celebrações religiosas ao longo do ano, como a procissão em honra a São João Batista no dia 24 de junho.